A mikrokontrollerekkel ellátott beágyazott FPGA-k speciális elektronikus alkatrészek, amelyek egyesítik a Field Programmable Gate Arrays rugalmasságát a mikrokontrollerek vezérlési képességeivel. Ez az integrált megoldás nagymértékben testreszabható és programozható logikai áramkörök létrehozását teszi lehetővé, amelyek az alkalmazások széles körére szabhatók, miközben a mikrokontrollerek által jellemzően kínált dedikált feldolgozási teljesítményt és vezérlési funkciókat is biztosítják. Általában összetett, valós idejű feldolgozási feladatokhoz használják olyan alkalmazásokban, mint az ipari vezérlőrendszerek, autóipari elektronika, kommunikációs infrastruktúrák és fogyasztói elektronika. Főbb jellemzőik közé tartozik az újrakonfigurálható hardverarchitektúra, amely lehetővé teszi a tervezők számára az áramkör frissítését még a telepítés után is, valamint egy chipen lévő mikrokontroller, amely képes kezelni az olyan feladatokat, mint az adatkezelés, az interfész és a rendszerfelügyelet.
In Gyakorlati körülmények között ezek a termékek kiválóak olyan helyzetekben, amelyek gyors prototípus-készítést, termékfejlesztést és a változó szabványokhoz vagy követelményekhez való alkalmazkodást igényelnek. Ideálisak az intelligens csatlakoztatott eszközökhöz, ahol bonyolult jelfeldolgozó algoritmusokat tudnak kezelni, miközben a rendszerfunkciókat is felügyelik. Ez a sokoldalúság és a képességek integrálása csökkenti annak szükségességét, hogy egy áramköri lapon több különálló alkatrészre legyen szükség, ami kompaktabb és költséghatékonyabb kialakítást eredményez. A mikrokontrollerekkel ellátott Embedded – FPGA-k neves gyártói közé tartozik a Xilinx, az Altera (jelenleg az Intel része), a Microsemi és a Lattice Semiconductor.