Atskirai programuotojai yra specializuoti įrenginiai, naudojami įvairių elektroninių komponentų atminčiai programuoti be pagrindinio kompiuterio. Šie įrenginiai yra būtini norint įkelti programinę įrangą arba programuoti duomenis tiesiai į mikrovaldiklius, EEPROM ir kitus programuojamus įrenginius. Paprastai juose yra patogios sąsajos, dažnai su LCD ekranais ir klaviatūros įvestimis, leidžiančiomis vartotojams pasirinkti ir įkelti reikiamus programavimo failus. Pagrindinės autonominių programuotojų funkcijos apima komponento atmintyje saugomo kodo skaitymą, rašymą ir tikrinimą, užtikrinant, kad kiekvienas įrenginys veiktų pagal jo dizaino specifikacijas.
Šie programuotojai yra sukurti taip, kad atitiktų konkrečias programas įvairiose srityse. įvairiose pramonės šakose, įskaitant automobilių elektroniką, buitinę elektroniką ir telekomunikacijas. Pavyzdžiui, automobilių pramonėje atskiri programuotojai gali būti naudojami mikrovaldikliams programuoti transporto priemonės ECU, kad būtų užtikrintas optimalus variklio veikimas ir išmetamųjų teršalų kontrolė. Pagrindinės šių gaminių savybės yra jų nešiojamumas, naudojimo paprastumas ir galimybė programuoti kelių tipų elektroninius komponentus. Populiarūs autonominių programuotojų gamintojai yra Microchip, Atmel ir Xeltek, žinomi dėl savo patikimų ir efektyvių programavimo sprendimų.