Innebygde mikrokontrollere som er applikasjonsspesifikke er spesialiserte elektroniske brikker designet for å utføre dedikerte funksjoner i større systemer. Disse mikrokontrollerne inneholder forhåndsprogrammert programvare som er skreddersydd for å administrere spesifikke oppgaver, for eksempel motorkontroll for biler, hjemmeautomatisering eller operasjoner for medisinsk utstyr. I motsetning til generelle mikrokontrollere, kan ikke funksjonene deres endres eller brukes på nytt for andre applikasjoner. De gir en kostnadseffektiv og effektiv løsning for produktutviklere som søker en komponent som pålitelig kan utføre enkeltstående operasjoner med høy presisjon og stabilitet. Vanlige kjennetegn ved disse mikrokontrollerne inkluderer lavt strømforbruk, kompakt design, sanntidsbehandlingsmuligheter og ulike kommunikasjonsgrensesnitt for sømløs integrering med andre elektroniske komponenter i et system.
Hovedbruken av disse mikrokontrollerne spenner over et bredt spekter av bransjer der de kontrollerer og optimerer ytelsen til visse produkter. For eksempel, i bilsektoren, kan de regulere bremsesystemer eller drivstoffinnsprøytning, mens i forbrukerelektronikk kan de finnes i smarte apparater eller dedikerte helseapparater. Produsenter som har etablert et rykte for å produsere applikasjonsspesifikke innebygde mikrokontrollere av høy kvalitet, inkluderer STMicroelectronics, Texas Instruments og Microchip Technology.